Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms