Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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SEC23BQ15437 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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SEC23BQ15437 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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SEC23BQ15437 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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SEC23BQ15437 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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SEC23BQ15437 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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