Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CNN3Q15417 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CNN3Q15417 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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