Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms