Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB3GAP1Q15042 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
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