Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms