Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEDD9Q14511 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
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