Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms