Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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COL4A6Q14031 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
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