Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
CDK13Q14004 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CDK13Q14004 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
CDK13Q14004 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CDK13Q14004 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
CDK13Q14004 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CDK13Q14004 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
CDK13Q14004 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CDK13Q14004 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CDK13Q14004 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CDK13Q14004 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CDK13Q14004 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CDK13Q14004 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
CDK13Q14004 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
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