Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBFBQ13951 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBFBQ13951 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBFBQ13951 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBFBQ13951 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBFBQ13951 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBFBQ13951 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CBFBQ13951 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBFBQ13951 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBFBQ13951 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBFBQ13951 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBFBQ13951 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CBFBQ13951 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBFBQ13951 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CBFBQ13951 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBFBQ13951 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CBFBQ13951 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CBFBQ13951 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CBFBQ13951 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CBFBQ13951 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CBFBQ13951 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CBFBQ13951 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBFBQ13951 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBFBQ13951 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBFBQ13951 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBFBQ13951 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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