Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX2Q13950 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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