Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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