Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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