Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
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