Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
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