Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGDRQ13258 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
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