Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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