Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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