Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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