Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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