Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRJQ12913 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRJQ12913 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms