Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SFSWAPQ12872 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms