Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXO1Q12778 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms