Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

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Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 CGR1YGL029W 363 nt3.42□□□□□ -1.86
HER1Q12276 ATG10YLL042C 504 nt3.42□□□□□ -1.86
HER1Q12276 TVP18YMR071C 504 nt3.42□□□□□ -1.86
HER1Q12276 RPL13BYMR142C 600 nt3.42□□□□□ -1.86
HER1Q12276 IMP1YMR150C 573 nt3.42□□□□□ -1.86
HER1Q12276 RPS8AYBL072C 603 nt3.42□□□□□ -1.86
HER1Q12276 INN1YNL152W 1230 nt3.42□□□□□ -1.86
HER1Q12276 YDL199CYDL199C 2064 nt3.42□□□□□ -1.86
HER1Q12276 ERG11YHR007C 1593 nt3.42□□□□□ -1.86
HER1Q12276 TFB2YPL122C 1542 nt3.41□□□□□ -1.86
HER1Q12276 MET32YDR253C 576 nt3.41□□□□□ -1.86
HER1Q12276 PMI40YER003C 1290 nt3.41□□□□□ -1.86
HER1Q12276 SPT2YER161C 1002 nt3.41□□□□□ -1.86
HER1Q12276 CFD1YIL003W 882 nt3.41□□□□□ -1.86
HER1Q12276 RPL16AYIL133C 600 nt3.41□□□□□ -1.86
HER1Q12276 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt3.41□□□□□ -1.86
HER1Q12276 YLR416CYLR416C 399 nt3.41□□□□□ -1.86
HER1Q12276 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt3.41□□□□□ -1.86
HER1Q12276 SWS2YNL081C 432 nt3.41□□□□□ -1.86
HER1Q12276 YPL035CYPL035C 348 nt3.41□□□□□ -1.86
HER1Q12276 LEE1YPL054W 906 nt3.41□□□□□ -1.86
HER1Q12276 CDC45YLR103C 1953 nt3.41□□□□□ -1.86
HER1Q12276 KAP95YLR347C 2586 nt3.41□□□□□ -1.86
HER1Q12276 ARP4YJL081C 1470 nt3.41□□□□□ -1.86
HER1Q12276 TCB3YML072C 4638 nt3.4□□□□□ -1.86
HER1Q12276 YJR030CYJR030C 2238 nt3.4□□□□□ -1.86
HER1Q12276 WHI3YNL197C 1986 nt3.4□□□□□ -1.86
HER1Q12276 ARP5YNL059C 2268 nt3.4□□□□□ -1.86
HER1Q12276 AFR1YDR085C 1863 nt3.4□□□□□ -1.87
HER1Q12276 VAB2YEL005C 849 nt3.4□□□□□ -1.87
HER1Q12276 GLC7YER133W 939 nt3.4□□□□□ -1.87
HER1Q12276 SEC4YFL005W 648 nt3.4□□□□□ -1.87
HER1Q12276 RPL1BYGL135W 654 nt3.4□□□□□ -1.87
HER1Q12276 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.4□□□□□ -1.87
HER1Q12276 IRC19YLL033W 693 nt3.4□□□□□ -1.87
HER1Q12276 YAR070CYAR070C 300 nt3.4□□□□□ -1.87
HER1Q12276 RDN58-1RDN58-1 158 nt3.4□□□□□ -1.87
HER1Q12276 RDN58-2RDN58-2 158 nt3.4□□□□□ -1.87
HER1Q12276 RAD33YML011C 534 nt3.4□□□□□ -1.87
HER1Q12276 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt3.4□□□□□ -1.87
HER1Q12276 YNL058CYNL058C 951 nt3.4□□□□□ -1.87
HER1Q12276 RHO5YNL180C 996 nt3.4□□□□□ -1.87
HER1Q12276 RPS7AYOR096W 573 nt3.4□□□□□ -1.87
HER1Q12276 RPL1AYPL220W 654 nt3.4□□□□□ -1.87
HER1Q12276 YGR237CYGR237C 2358 nt3.39□□□□□ -1.87
HER1Q12276 VPS33YLR396C 2076 nt3.39□□□□□ -1.87
HER1Q12276 YDL242WYDL242W 354 nt3.39□□□□□ -1.87
HER1Q12276 VMA8YEL051W 771 nt3.39□□□□□ -1.87
HER1Q12276 RPS23AYGR118W 438 nt3.39□□□□□ -1.87
HER1Q12276 RPI1YIL119C 1224 nt3.39□□□□□ -1.87
HER1Q12276 YMR087WYMR087W 855 nt3.39□□□□□ -1.87
HER1Q12276 ASI2YNL159C 870 nt3.39□□□□□ -1.87
HER1Q12276 PHO80YOL001W 882 nt3.39□□□□□ -1.87
HER1Q12276 HHF1YBR009C 312 nt3.39□□□□□ -1.87
HER1Q12276 RPS23BYPR132W 438 nt3.39□□□□□ -1.87
HER1Q12276 NEL1YHR035W 1893 nt3.39□□□□□ -1.87
HER1Q12276 PHO81YGR233C 3537 nt3.38□□□□□ -1.87
HER1Q12276 COX13YGL191W 390 nt3.38□□□□□ -1.87
HER1Q12276 EPT1YHR123W 1176 nt3.38□□□□□ -1.87
HER1Q12276 SDL1YIL167W 633 nt3.38□□□□□ -1.87
HER1Q12276 NNF1YJR112W 606 nt3.38□□□□□ -1.87
HER1Q12276 YET1YKL065C 621 nt3.38□□□□□ -1.87
HER1Q12276 ATP18YML081C-A 180 nt3.38□□□□□ -1.87
HER1Q12276 TOM22YNL131W 459 nt3.38□□□□□ -1.87
HER1Q12276 ATG3YNR007C 933 nt3.38□□□□□ -1.87
HER1Q12276 GCY1YOR120W 939 nt3.38□□□□□ -1.87
HER1Q12276 SUS1YBR111W-A 291 nt3.38□□□□□ -1.87
HER1Q12276 RDS1YCR106W 2499 nt3.38□□□□□ -1.87
HER1Q12276 SEC15YGL233W 2733 nt3.38□□□□□ -1.87
HER1Q12276 YBP2YGL060W 1926 nt3.38□□□□□ -1.87
HER1Q12276 HRD1YOL013C 1656 nt3.37□□□□□ -1.87
HER1Q12276 FKH2YNL068C 2589 nt3.37□□□□□ -1.87
HER1Q12276 RPA14YDR156W 414 nt3.37□□□□□ -1.87
HER1Q12276 PUG1YER185W 912 nt3.37□□□□□ -1.87
HER1Q12276 YJL119CYJL119C 324 nt3.37□□□□□ -1.87
HER1Q12276 EMC2YJR088C 879 nt3.37□□□□□ -1.87
HER1Q12276 YLR171WYLR171W 390 nt3.37□□□□□ -1.87
HER1Q12276 YBL071CYBL071C 309 nt3.37□□□□□ -1.87
HER1Q12276 APD1YBR151W 951 nt3.37□□□□□ -1.87
HER1Q12276 DER1YBR201W 636 nt3.37□□□□□ -1.87
HER1Q12276 MSD1YPL104W 1977 nt3.37□□□□□ -1.87
HER1Q12276 HUL5YGL141W 2733 nt3.37□□□□□ -1.87
HER1Q12276 YEL025CYEL025C 3567 nt3.36□□□□□ -1.87
HER1Q12276 PIN4YBL051C 2007 nt3.36□□□□□ -1.87
HER1Q12276 PKH1YDR490C 2301 nt3.36□□□□□ -1.87
HER1Q12276 RRN6YBL014C 2685 nt3.36□□□□□ -1.87
HER1Q12276 YDR090CYDR090C 933 nt3.36□□□□□ -1.87
HER1Q12276 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt3.36□□□□□ -1.87
HER1Q12276 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt3.36□□□□□ -1.87
HER1Q12276 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt3.36□□□□□ -1.87
HER1Q12276 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt3.36□□□□□ -1.87
HER1Q12276 NCB2YDR397C 441 nt3.36□□□□□ -1.87
HER1Q12276 IES5YER092W 378 nt3.36□□□□□ -1.87
HER1Q12276 ECO1YFR027W 846 nt3.36□□□□□ -1.87
HER1Q12276 YHR130CYHR130C 336 nt3.36□□□□□ -1.87
HER1Q12276 YJR011CYJR011C 786 nt3.36□□□□□ -1.87
HER1Q12276 ENV10YLR065C 546 nt3.36□□□□□ -1.87
HER1Q12276 ARC18YLR370C 537 nt3.36□□□□□ -1.87
HER1Q12276 BER1YLR412W 825 nt3.36□□□□□ -1.87
HER1Q12276 GIS2YNL255C 462 nt3.36□□□□□ -1.87
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