Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 YIP3YNL044W 531 nt2.84□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 YNL089CYNL089C 477 nt2.84□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt2.84□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 RRG7YOR305W 729 nt2.84□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 MRPL40YPL173W 894 nt2.84□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 YJL049WYJL049W 1353 nt2.84□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 ARK1YNL020C 1917 nt2.83□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 ISW1YBR245C 3390 nt2.83□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 NTO1YPR031W 2247 nt2.83□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 YGL204CYGL204C 306 nt2.83□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 ARC18YLR370C 537 nt2.83□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 YBR116CYBR116C 528 nt2.83□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 PBS2YJL128C 2007 nt2.83□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 ERT1YBR239C 1590 nt2.83□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.82□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 YKL115CYKL115C 393 nt2.82□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 SDH3YKL141W 597 nt2.82□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 RPL8BYLL045C 771 nt2.82□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 DYN3YMR299C 939 nt2.82□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 KAR4YCL055W 1008 nt2.82□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 COM2YER130C 1332 nt2.82□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 ESA1YOR244W 1338 nt2.82□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 ART10YLR392C 1557 nt2.82□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 NMA111YNL123W 2994 nt2.82□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 GCV2YMR189W 3105 nt2.82□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 RIM13YMR154C 2184 nt2.81□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 FIR1YER032W 2631 nt2.81□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 KEL2YGR238C 2649 nt2.81□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 SAK1YER129W 3429 nt2.81□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 DTD1YDL219W 453 nt2.81□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 TIM11YDR322C-A 291 nt2.81□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 YHL044WYHL044W 708 nt2.81□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt2.81□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 YJR056CYJR056C 711 nt2.81□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 SDO1YLR022C 753 nt2.81□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 RPL16BYNL069C 597 nt2.81□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 RPL23AYBL087C 414 nt2.81□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 VAM3YOR106W 852 nt2.81□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 RPC40YPR110C 1008 nt2.81□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 SRP1YNL189W 1629 nt2.81□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 FUS2YMR232W 2034 nt2.81□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 SRB4YER022W 2064 nt2.8□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 TRM2YKR056W 1920 nt2.8□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 ANR2YKL047W 1551 nt2.8□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 KAR1YNL188W 1302 nt2.8□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 SAE2YGL175C 1038 nt2.8□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 PIR1YKL164C 1026 nt2.8□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 YOR277CYOR277C 309 nt2.8□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 GEA1YJR031C 4227 nt2.8□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 HEH2YDR458C 1992 nt2.8□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 SNQ2YDR011W 4506 nt2.8□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 MAK11YKL021C 1407 nt2.79□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 GCD10YNL062C 1437 nt2.79□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 SLF1YDR515W 1344 nt2.79□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 SRD1YCR018C 666 nt2.79□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 YGR293CYGR293C 462 nt2.79□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 QCR10YHR001W-A 234 nt2.79□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 SVP26YHR181W 687 nt2.79□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 GPN3YLR243W 819 nt2.79□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 BTS1YPL069C 1008 nt2.79□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 ASI3YNL008C 2031 nt2.79□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 SIN3YOL004W 4611 nt2.79□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 SRB7YDR308C 423 nt2.78□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 ERG28YER044C 447 nt2.78□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.78□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 YFL015CYFL015C 495 nt2.78□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 GOS1YHL031C 672 nt2.78□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt2.78□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 YHR022CYHR022C 771 nt2.78□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 CUP1-1YHR053C 186 nt2.78□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 CUP1-2YHR055C 186 nt2.78□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 AIM23YJL131C 1071 nt2.78□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 MRPL33YMR286W 261 nt2.78□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 YSF3YNL138W-A 258 nt2.78□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 snR42snR42 351 nt2.78□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 TMA64YDR117C 1698 nt2.78□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 DBF20YPR111W 1695 nt2.78□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 BUD4YJR092W 4344 nt2.78□□□□□ -1.96
NFI1Q12216 YGR067CYGR067C 2415 nt2.78□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 YLR108CYLR108C 1458 nt2.77□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 YEF3YLR249W 3135 nt2.77□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 SEC7YDR170C 6030 nt2.77□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 RUB1YDR139C 234 nt2.77□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 RPL22BYFL034C-A 369 nt2.77□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 YHR180WYHR180W 492 nt2.77□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 YLR257WYLR257W 966 nt2.77□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 APC2YLR127C 2562 nt2.77□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 YKU80YMR106C 1890 nt2.77□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 YKR078WYKR078W 1758 nt2.77□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 SLP1YOR154W 1764 nt2.77□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 CST9YLR394W 1449 nt2.76□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 YGL176CYGL176C 1665 nt2.76□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 SMY2YBR172C 2223 nt2.76□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 MVB12YGR206W 306 nt2.76□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 YHL005CYHL005C 393 nt2.76□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 RPS22AYJL190C 393 nt2.76□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 ATG10YLL042C 504 nt2.76□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 ATP3YBR039W 936 nt2.76□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 ARO4YBR249C 1113 nt2.76□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 TOP2YNL088W 4287 nt2.76□□□□□ -1.97
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