Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms