Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms