Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms