Protein–RNA interactions for Protein: Q08685

CLP1, mRNA cleavage and polyadenylation factor CLP1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLP1Q08685 RRP7YCL031C 894 nt2.6□□□□□ -1.99
CLP1Q08685 SMC6YLR383W 3345 nt2.6□□□□□ -1.99
CLP1Q08685 MAK5YBR142W 2322 nt2.6□□□□□ -1.99
CLP1Q08685 NUP170YBL079W 4509 nt2.6□□□□□ -1.99
CLP1Q08685 BUD26YDR241W 288 nt2.59□□□□□ -1.99
CLP1Q08685 LRS4YDR439W 1044 nt2.59□□□□□ -1.99
CLP1Q08685 PMI40YER003C 1290 nt2.59□□□□□ -1.99
CLP1Q08685 PRE1YER012W 597 nt2.59□□□□□ -1.99
CLP1Q08685 YGR111WYGR111W 1203 nt2.59□□□□□ -1.99
CLP1Q08685 YIL174WYIL174W 228 nt2.59□□□□□ -1.99
CLP1Q08685 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.59□□□□□ -1.99
CLP1Q08685 YKL162CYKL162C 1209 nt2.59□□□□□ -1.99
CLP1Q08685 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt2.59□□□□□ -1.99
CLP1Q08685 YML047W-AYML047W-A 366 nt2.59□□□□□ -1.99
CLP1Q08685 YBL028CYBL028C 321 nt2.59□□□□□ -1.99
CLP1Q08685 SUR1YPL057C 1149 nt2.59□□□□□ -1.99
CLP1Q08685 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt2.59□□□□□ -1.99
CLP1Q08685 CBP6YBR120C 489 nt2.59□□□□□ -1.99
CLP1Q08685 PDR1YGL013C 3207 nt2.59□□□□□ -1.99
CLP1Q08685 BOI1YBL085W 2943 nt2.59□□□□□ -1.99
CLP1Q08685 NUF2YOL069W 1356 nt2.59□□□□□ -2
CLP1Q08685 REV3YPL167C 4515 nt2.59□□□□□ -2
CLP1Q08685 DSS1YMR287C 2910 nt2.58□□□□□ -2
CLP1Q08685 YRB1YDR002W 606 nt2.58□□□□□ -2
CLP1Q08685 RTT105YER104W 627 nt2.58□□□□□ -2
CLP1Q08685 COG2YGR120C 789 nt2.58□□□□□ -2
CLP1Q08685 RPL14BYHL001W 417 nt2.58□□□□□ -2
CLP1Q08685 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt2.58□□□□□ -2
CLP1Q08685 LSM8YJR022W 330 nt2.58□□□□□ -2
CLP1Q08685 RPF2YKR081C 1035 nt2.58□□□□□ -2
CLP1Q08685 TRM112YNR046W 408 nt2.58□□□□□ -2
CLP1Q08685 YOL134CYOL134C 390 nt2.58□□□□□ -2
CLP1Q08685 PFK27YOL136C 1194 nt2.58□□□□□ -2
CLP1Q08685 YOR283WYOR283W 693 nt2.58□□□□□ -2
CLP1Q08685 YDR186CYDR186C 2634 nt2.58□□□□□ -2
CLP1Q08685 MSH4YFL003C 2637 nt2.58□□□□□ -2
CLP1Q08685 YJL132WYJL132W 2253 nt2.58□□□□□ -2
CLP1Q08685 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.57□□□□□ -2
CLP1Q08685 SHR3YDL212W 633 nt2.57□□□□□ -2
CLP1Q08685 FSH1YHR049W 732 nt2.57□□□□□ -2
CLP1Q08685 ARC19YKL013C 516 nt2.57□□□□□ -2
CLP1Q08685 SUB1YMR039C 879 nt2.57□□□□□ -2
CLP1Q08685 RPB8YOR224C 441 nt2.57□□□□□ -2
CLP1Q08685 AXL1YPR122W 3627 nt2.56□□□□□ -2
CLP1Q08685 RPL35BYDL136W 363 nt2.56□□□□□ -2
CLP1Q08685 PLP1YDR183W 693 nt2.56□□□□□ -2
CLP1Q08685 GIC2YDR309C 1152 nt2.56□□□□□ -2
CLP1Q08685 PIB1YDR313C 861 nt2.56□□□□□ -2
CLP1Q08685 YGL159WYGL159W 1113 nt2.56□□□□□ -2
CLP1Q08685 PAU14YIL176C 363 nt2.56□□□□□ -2
CLP1Q08685 ASG7YJL170C 630 nt2.56□□□□□ -2
CLP1Q08685 PAU1YJL223C 363 nt2.56□□□□□ -2
CLP1Q08685 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt2.56□□□□□ -2
CLP1Q08685 RDN58-1RDN58-1 158 nt2.56□□□□□ -2
CLP1Q08685 RDN58-2RDN58-2 158 nt2.56□□□□□ -2
CLP1Q08685 PNO1YOR145C 825 nt2.56□□□□□ -2
CLP1Q08685 AYT1YLL063C 1425 nt2.56□□□□□ -2
CLP1Q08685 MDM10YAL010C 1482 nt2.56□□□□□ -2
CLP1Q08685 PLM2YDR501W 1566 nt2.56□□□□□ -2
CLP1Q08685 CET1YPL228W 1650 nt2.56□□□□□ -2
CLP1Q08685 INO80YGL150C 4470 nt2.56□□□□□ -2
CLP1Q08685 EDS1YBR033W 2760 nt2.55□□□□□ -2
CLP1Q08685 AMS1YGL156W 3252 nt2.55□□□□□ -2
CLP1Q08685 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt2.55□□□□□ -2
CLP1Q08685 GSP1YLR293C 660 nt2.55□□□□□ -2
CLP1Q08685 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt2.55□□□□□ -2
CLP1Q08685 YOR050CYOR050C 348 nt2.55□□□□□ -2
CLP1Q08685 ATG5YPL149W 885 nt2.55□□□□□ -2
CLP1Q08685 HAA1YPR008W 2085 nt2.55□□□□□ -2
CLP1Q08685 YBR292CYBR292C 372 nt2.55□□□□□ -2
CLP1Q08685 TOM1YDR457W 9807 nt2.55□□□□□ -2
CLP1Q08685 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.54□□□□□ -2
CLP1Q08685 YIP5YGL161C 933 nt2.54□□□□□ -2
CLP1Q08685 FIP1YJR093C 984 nt2.54□□□□□ -2
CLP1Q08685 CWC24YLR323C 780 nt2.54□□□□□ -2
CLP1Q08685 YNL046WYNL046W 519 nt2.54□□□□□ -2
CLP1Q08685 DCP1YOL149W 696 nt2.54□□□□□ -2
CLP1Q08685 YBT1YLL048C 4986 nt2.54□□□□□ -2
CLP1Q08685 VTC3YPL019C 2508 nt2.53□□□□□ -2
CLP1Q08685 SPB1YCL054W 2526 nt2.53□□□□□ -2
CLP1Q08685 VPS9YML097C 1356 nt2.53□□□□□ -2
CLP1Q08685 RSM24YDR175C 960 nt2.53□□□□□ -2
CLP1Q08685 YGL177WYGL177W 348 nt2.53□□□□□ -2
CLP1Q08685 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt2.53□□□□□ -2
CLP1Q08685 CDC123YLR215C 1083 nt2.53□□□□□ -2
CLP1Q08685 TMA10YLR327C 261 nt2.53□□□□□ -2
CLP1Q08685 YML094C-AYML094C-A 402 nt2.53□□□□□ -2
CLP1Q08685 YOL162WYOL162W 648 nt2.53□□□□□ -2
CLP1Q08685 SCY1YGL083W 2415 nt2.53□□□□□ -2
CLP1Q08685 YPR097WYPR097W 3222 nt2.53□□□□□ -2.01
CLP1Q08685 NUM1YDR150W 8247 nt2.53□□□□□ -2.01
CLP1Q08685 YPK1YKL126W 2043 nt2.52□□□□□ -2.01
CLP1Q08685 YKR078WYKR078W 1758 nt2.52□□□□□ -2.01
CLP1Q08685 IZH1YDR492W 951 nt2.52□□□□□ -2.01
CLP1Q08685 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt2.52□□□□□ -2.01
CLP1Q08685 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt2.52□□□□□ -2.01
CLP1Q08685 NEJ1YLR265C 1029 nt2.52□□□□□ -2.01
CLP1Q08685 YBL062WYBL062W 381 nt2.52□□□□□ -2.01
CLP1Q08685 YNL035CYNL035C 1170 nt2.52□□□□□ -2.01
CLP1Q08685 YPL035CYPL035C 348 nt2.52□□□□□ -2.01
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