Protein–RNA interactions for Protein: Q08387

DNL4, DNA ligase 4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 944 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DNL4Q08387 YJR027WYJR027W 5268 nt2.89□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.89□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YML039WYML039W 5268 nt2.89□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YML045WYML045W 5268 nt2.89□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YMR050CYMR050C 5268 nt2.89□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.89□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.89□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.89□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.89□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.89□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt2.89□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YGR073CYGR073C 372 nt2.89□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.89□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YLL037WYLL037W 381 nt2.89□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 RCE1YMR274C 948 nt2.89□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YNL109WYNL109W 546 nt2.89□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 MCA1YOR197W 1299 nt2.89□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YOR387CYOR387C 621 nt2.89□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 BEM4YPL161C 1902 nt2.89□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YCG1YDR325W 3108 nt2.88□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 MNT3YIL014W 1893 nt2.88□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 SGS1YMR190C 4344 nt2.88□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 GYP7YDL234C 2241 nt2.88□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 GPM2YDL021W 936 nt2.88□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YDL050CYDL050C 372 nt2.88□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 BRR6YGL247W 594 nt2.88□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 BTN2YGR142W 1233 nt2.88□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.88□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 RGI2YIL057C 495 nt2.88□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.88□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.88□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.88□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.88□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.88□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 ENV10YLR065C 546 nt2.88□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 DLT1YMR126C 1029 nt2.88□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YNL050CYNL050C 813 nt2.88□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YPL107WYPL107W 747 nt2.88□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 PPT2YPL148C 522 nt2.88□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 ATP20YPR020W 348 nt2.88□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 MMS1YPR164W 4224 nt2.88□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 CDC20YGL116W 1833 nt2.88□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 GYL1YMR192W 2163 nt2.88□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YPL150WYPL150W 2706 nt2.88□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 AI4Q0065 1671 nt2.88□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 TPO5YKL174C 1857 nt2.88□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 ENP2YGR145W 2124 nt2.87□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 UBC5YDR059C 447 nt2.87□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 HTB1YDR224C 396 nt2.87□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YDR491CYDR491C 492 nt2.87□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YLR400WYLR400W 474 nt2.87□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 ERG29YMR134W 714 nt2.87□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 PEX27YOR193W 1131 nt2.87□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.87□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 NUR1YDL089W 1455 nt2.87□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 TOM70YNL121C 1854 nt2.87□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 IRC3YDR332W 2070 nt2.86□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 PSP1YDR505C 2526 nt2.86□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 APC11YDL008W 498 nt2.86□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YEA4YEL004W 1029 nt2.86□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 SMX2YFL017W-A 234 nt2.86□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 EFG1YGR271C-A 702 nt2.86□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YKL131WYKL131W 522 nt2.86□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 BET5YML077W 480 nt2.86□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 SUB1YMR039C 879 nt2.86□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 GRX7YBR014C 612 nt2.86□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YOR203WYOR203W 354 nt2.86□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 snR43snR43 209 nt2.86□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YBR287WYBR287W 1284 nt2.86□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 PDR3YBL005W 2931 nt2.86□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 CIK1YMR198W 1785 nt2.86□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YLR001CYLR001C 2589 nt2.86□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 APC5YOR249C 2058 nt2.85□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 snR83snR83 306 nt2.85□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 RGI1YER067W 486 nt2.85□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YHR054CYHR054C 1065 nt2.85□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 IKI1YHR187W 930 nt2.85□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 NNT1YLR285W 786 nt2.85□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 PEX15YOL044W 1152 nt2.85□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 SPR2YOR214C 711 nt2.85□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YOR366WYOR366W 354 nt2.85□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YOR385WYOR385W 873 nt2.85□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 CIN2YPL241C 807 nt2.85□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.85□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 MPS1YDL028C 2295 nt2.85□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 APM3YBR288C 1452 nt2.84□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 MUS81YDR386W 1899 nt2.84□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 MET5YJR137C 4329 nt2.84□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 ERG11YHR007C 1593 nt2.84□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 RNR2YJL026W 1200 nt2.84□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 YJL032WYJL032W 315 nt2.84□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 RCN1YKL159C 636 nt2.84□□□□□ -1.95
DNL4Q08387 SLH1YGR271W 5904 nt2.84□□□□□ -1.96
DNL4Q08387 NSA1YGL111W 1392 nt2.84□□□□□ -1.96
DNL4Q08387 SLY41YOR307C 1362 nt2.84□□□□□ -1.96
DNL4Q08387 DIA2YOR080W 2199 nt2.84□□□□□ -1.96
DNL4Q08387 DUF1YOL087C 3351 nt2.84□□□□□ -1.96
DNL4Q08387 SWC4YGR002C 1431 nt2.84□□□□□ -1.96
DNL4Q08387 EXO84YBR102C 2262 nt2.84□□□□□ -1.96
DNL4Q08387 FKS3YMR306W 5358 nt2.83□□□□□ -1.96
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