Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms