Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN12Q05209 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms