Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT17Q04695 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms