Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OCA2Q04671 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OCA2Q04671 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms