Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
ERCC6Q03468 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ERCC6Q03468 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms