Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUCB1Q02818 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms