Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms