Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F1Q01094 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms