Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms