Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP5P82980 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP5P82980 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP5P82980 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP5P82980 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP5P82980 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP5P82980 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP5P82980 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP5P82980 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP5P82980 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP5P82980 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP5P82980 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP5P82980 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP5P82980 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP5P82980 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP5P82980 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP5P82980 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP5P82980 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP5P82980 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP5P82980 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP5P82980 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP5P82980 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP5P82980 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP5P82980 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP5P82980 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP5P82980 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP5P82980 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP5P82980 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP5P82980 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP5P82980 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP5P82980 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP5P82980 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP5P82980 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP5P82980 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP5P82980 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP5P82980 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP5P82980 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP5P82980 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP5P82980 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP5P82980 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP5P82980 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP5P82980 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP5P82980 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP5P82980 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP5P82980 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RBP5P82980 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RBP5P82980 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RBP5P82980 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBP5P82980 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBP5P82980 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBP5P82980 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBP5P82980 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBP5P82980 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBP5P82980 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBP5P82980 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBP5P82980 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBP5P82980 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBP5P82980 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBP5P82980 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBP5P82980 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBP5P82980 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBP5P82980 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBP5P82980 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBP5P82980 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBP5P82980 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBP5P82980 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBP5P82980 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBP5P82980 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBP5P82980 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBP5P82980 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBP5P82980 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP5P82980 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP5P82980 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP5P82980 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP5P82980 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP5P82980 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP5P82980 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP5P82980 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP5P82980 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP5P82980 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP5P82980 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP5P82980 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP5P82980 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP5P82980 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP5P82980 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP5P82980 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP5P82980 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP5P82980 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP5P82980 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP5P82980 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP5P82980 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP5P82980 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP5P82980 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP5P82980 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP5P82980 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP5P82980 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP5P82980 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP5P82980 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP5P82980 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP5P82980 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms