Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HBBP68871 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HBBP68871 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HBBP68871 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HBBP68871 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HBBP68871 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HBBP68871 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HBBP68871 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HBBP68871 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HBBP68871 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HBBP68871 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HBBP68871 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HBBP68871 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HBBP68871 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HBBP68871 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HBBP68871 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HBBP68871 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HBBP68871 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HBBP68871 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HBBP68871 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HBBP68871 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HBBP68871 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HBBP68871 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HBBP68871 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HBBP68871 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HBBP68871 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HBBP68871 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HBBP68871 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HBBP68871 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HBBP68871 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HBBP68871 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HBBP68871 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HBBP68871 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HBBP68871 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HBBP68871 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBBP68871 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBBP68871 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBBP68871 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBBP68871 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBBP68871 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBBP68871 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBBP68871 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBBP68871 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBBP68871 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBBP68871 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBBP68871 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBBP68871 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBBP68871 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBBP68871 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBBP68871 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBBP68871 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBBP68871 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBBP68871 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms