Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms