Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP54P61011 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP54P61011 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP54P61011 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP54P61011 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP54P61011 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP54P61011 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP54P61011 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP54P61011 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP54P61011 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP54P61011 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP54P61011 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP54P61011 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP54P61011 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP54P61011 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP54P61011 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP54P61011 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP54P61011 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP54P61011 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP54P61011 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP54P61011 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP54P61011 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP54P61011 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP54P61011 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP54P61011 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP54P61011 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP54P61011 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP54P61011 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP54P61011 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP54P61011 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP54P61011 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP54P61011 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP54P61011 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP54P61011 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP54P61011 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP54P61011 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP54P61011 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP54P61011 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP54P61011 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP54P61011 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP54P61011 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP54P61011 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP54P61011 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP54P61011 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP54P61011 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP54P61011 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP54P61011 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP54P61011 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP54P61011 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP54P61011 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP54P61011 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP54P61011 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP54P61011 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP54P61011 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP54P61011 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP54P61011 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP54P61011 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP54P61011 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP54P61011 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP54P61011 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP54P61011 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP54P61011 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP54P61011 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP54P61011 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP54P61011 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP54P61011 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP54P61011 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP54P61011 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP54P61011 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP54P61011 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRP54P61011 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRP54P61011 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRP54P61011 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRP54P61011 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRP54P61011 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRP54P61011 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRP54P61011 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRP54P61011 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRP54P61011 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRP54P61011 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRP54P61011 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRP54P61011 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRP54P61011 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRP54P61011 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRP54P61011 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRP54P61011 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRP54P61011 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRP54P61011 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRP54P61011 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRP54P61011 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRP54P61011 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRP54P61011 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRP54P61011 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRP54P61011 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRP54P61011 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRP54P61011 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SRP54P61011 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRP54P61011 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRP54P61011 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRP54P61011 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms