Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3EP60228 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EIF3EP60228 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EIF3EP60228 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EIF3EP60228 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EIF3EP60228 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EIF3EP60228 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EIF3EP60228 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EIF3EP60228 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3EP60228 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3EP60228 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3EP60228 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3EP60228 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3EP60228 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3EP60228 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3EP60228 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3EP60228 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3EP60228 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3EP60228 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3EP60228 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3EP60228 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3EP60228 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3EP60228 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3EP60228 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3EP60228 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms