Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms