Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CABP4P57796 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CABP4P57796 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CABP4P57796 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CABP4P57796 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CABP4P57796 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CABP4P57796 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CABP4P57796 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CABP4P57796 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CABP4P57796 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CABP4P57796 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CABP4P57796 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CABP4P57796 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CABP4P57796 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CABP4P57796 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CABP4P57796 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CABP4P57796 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CABP4P57796 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CABP4P57796 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CABP4P57796 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CABP4P57796 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CABP4P57796 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CABP4P57796 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CABP4P57796 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CABP4P57796 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CABP4P57796 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CABP4P57796 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CABP4P57796 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CABP4P57796 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CABP4P57796 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CABP4P57796 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CABP4P57796 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CABP4P57796 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CABP4P57796 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CABP4P57796 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CABP4P57796 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CABP4P57796 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CABP4P57796 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CABP4P57796 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CABP4P57796 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CABP4P57796 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CABP4P57796 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CABP4P57796 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CABP4P57796 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CABP4P57796 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CABP4P57796 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CABP4P57796 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CABP4P57796 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CABP4P57796 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CABP4P57796 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CABP4P57796 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CABP4P57796 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CABP4P57796 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CABP4P57796 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CABP4P57796 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CABP4P57796 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP4P57796 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP4P57796 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP4P57796 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP4P57796 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP4P57796 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP4P57796 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP4P57796 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP4P57796 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP4P57796 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP4P57796 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP4P57796 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP4P57796 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP4P57796 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP4P57796 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP4P57796 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP4P57796 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP4P57796 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP4P57796 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP4P57796 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP4P57796 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP4P57796 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP4P57796 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP4P57796 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP4P57796 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP4P57796 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP4P57796 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP4P57796 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP4P57796 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP4P57796 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP4P57796 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP4P57796 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP4P57796 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP4P57796 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CABP4P57796 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CABP4P57796 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CABP4P57796 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CABP4P57796 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CABP4P57796 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CABP4P57796 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CABP4P57796 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CABP4P57796 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CABP4P57796 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CABP4P57796 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CABP4P57796 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms