Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLF3P57682 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLF3P57682 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF3P57682 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF3P57682 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF3P57682 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF3P57682 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF3P57682 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF3P57682 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF3P57682 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF3P57682 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF3P57682 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF3P57682 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF3P57682 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF3P57682 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF3P57682 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF3P57682 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF3P57682 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF3P57682 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF3P57682 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF3P57682 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF3P57682 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF3P57682 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF3P57682 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF3P57682 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF3P57682 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF3P57682 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF3P57682 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF3P57682 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF3P57682 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF3P57682 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF3P57682 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF3P57682 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF3P57682 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF3P57682 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF3P57682 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF3P57682 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF3P57682 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF3P57682 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF3P57682 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF3P57682 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF3P57682 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF3P57682 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF3P57682 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF3P57682 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF3P57682 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF3P57682 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF3P57682 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF3P57682 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF3P57682 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF3P57682 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF3P57682 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF3P57682 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF3P57682 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF3P57682 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF3P57682 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF3P57682 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF3P57682 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF3P57682 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF3P57682 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF3P57682 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF3P57682 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF3P57682 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF3P57682 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF3P57682 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF3P57682 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF3P57682 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF3P57682 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF3P57682 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF3P57682 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF3P57682 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF3P57682 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF3P57682 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF3P57682 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF3P57682 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF3P57682 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF3P57682 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF3P57682 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF3P57682 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF3P57682 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF3P57682 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF3P57682 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF3P57682 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF3P57682 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF3P57682 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF3P57682 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF3P57682 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF3P57682 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF3P57682 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF3P57682 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF3P57682 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF3P57682 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF3P57682 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF3P57682 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF3P57682 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF3P57682 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF3P57682 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF3P57682 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF3P57682 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF3P57682 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms