Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX10P56693 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX10P56693 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX10P56693 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX10P56693 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX10P56693 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX10P56693 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX10P56693 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX10P56693 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX10P56693 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX10P56693 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX10P56693 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX10P56693 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX10P56693 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX10P56693 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX10P56693 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX10P56693 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX10P56693 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX10P56693 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX10P56693 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX10P56693 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX10P56693 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX10P56693 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX10P56693 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX10P56693 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX10P56693 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX10P56693 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX10P56693 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX10P56693 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX10P56693 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX10P56693 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX10P56693 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX10P56693 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX10P56693 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX10P56693 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX10P56693 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX10P56693 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX10P56693 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX10P56693 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX10P56693 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX10P56693 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX10P56693 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX10P56693 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX10P56693 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX10P56693 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX10P56693 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX10P56693 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX10P56693 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX10P56693 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX10P56693 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX10P56693 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX10P56693 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX10P56693 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX10P56693 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX10P56693 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX10P56693 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX10P56693 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX10P56693 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX10P56693 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX10P56693 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX10P56693 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX10P56693 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX10P56693 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX10P56693 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX10P56693 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX10P56693 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX10P56693 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX10P56693 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX10P56693 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX10P56693 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX10P56693 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX10P56693 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX10P56693 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX10P56693 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX10P56693 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX10P56693 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX10P56693 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX10P56693 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX10P56693 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX10P56693 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX10P56693 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX10P56693 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX10P56693 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX10P56693 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX10P56693 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX10P56693 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX10P56693 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX10P56693 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX10P56693 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX10P56693 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX10P56693 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX10P56693 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX10P56693 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX10P56693 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX10P56693 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX10P56693 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX10P56693 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX10P56693 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX10P56693 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX10P56693 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms