Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ELLP55199 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELLP55199 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ELLP55199 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELLP55199 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELLP55199 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELLP55199 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELLP55199 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELLP55199 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELLP55199 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELLP55199 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELLP55199 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELLP55199 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELLP55199 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELLP55199 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ELLP55199 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ELLP55199 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELLP55199 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELLP55199 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELLP55199 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELLP55199 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELLP55199 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELLP55199 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELLP55199 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELLP55199 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELLP55199 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELLP55199 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELLP55199 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELLP55199 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELLP55199 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ELLP55199 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELLP55199 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELLP55199 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELLP55199 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ELLP55199 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELLP55199 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELLP55199 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms